【R】map2でリストの成分名=ファイル名にし、各成分データを出力する方法
Rのリストに成分名が設定されているとき、それぞれの成分に格納されているデータフレームの一部を選択した上で、成分名をファイル名にして出力させる方法です。
Tidyverseのpurrrパッケージのmap2()
を使いました。
目次
環境
- Mac
- R
- R Studio
- Tidyverseパッケージ
データの例
想定しているのは、たとえば以下のような構造のリスト。(有名な「iris」データで代用)
data(iris)
library(tidyverse) # install済みを想定
df_list_iris <- list()
df_list_iris[["setosa"]] <- dplyr::filter(iris, Species == "setosa")
df_list_iris[["versicolor"]] <- dplyr::filter(iris, Species == "versicolor")
df_list_iris[["virginica"]] <- dplyr::filter(iris, Species == "virginica")
これで以下のようなリストを作成できました。
str(df_list_iris)
List of 3
$ setosa :'data.frame': 50 obs. of 5 variables:
..$ Sepal.Length: num [1:50] 5.1 4.9 4.7 4.6 5 5.4 4.6 5 4.4 4.9 ...
..$ Sepal.Width : num [1:50] 3.5 3 3.2 3.1 3.6 3.9 3.4 3.4 2.9 3.1 ...
..$ Petal.Length: num [1:50] 1.4 1.4 1.3 1.5 1.4 1.7 1.4 1.5 1.4 1.5 ...
..$ Petal.Width : num [1:50] 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.4 0.3 0.2 0.2 0.1 ...
..$ Species : Factor w/ 3 levels "setosa","versicolor",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ versicolor:'data.frame': 50 obs. of 5 variables:
..$ Sepal.Length: num [1:50] 7 6.4 6.9 5.5 6.5 5.7 6.3 4.9 6.6 5.2 ...
..$ Sepal.Width : num [1:50] 3.2 3.2 3.1 2.3 2.8 2.8 3.3 2.4 2.9 2.7 ...
..$ Petal.Length: num [1:50] 4.7 4.5 4.9 4 4.6 4.5 4.7 3.3 4.6 3.9 ...
..$ Petal.Width : num [1:50] 1.4 1.5 1.5 1.3 1.5 1.3 1.6 1 1.3 1.4 ...
..$ Species : Factor w/ 3 levels "setosa","versicolor",..: 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ...
$ virginica :'data.frame': 50 obs. of 5 variables:
..$ Sepal.Length: num [1:50] 6.3 5.8 7.1 6.3 6.5 7.6 4.9 7.3 6.7 7.2 ...
..$ Sepal.Width : num [1:50] 3.3 2.7 3 2.9 3 3 2.5 2.9 2.5 3.6 ...
..$ Petal.Length: num [1:50] 6 5.1 5.9 5.6 5.8 6.6 4.5 6.3 5.8 6.1 ...
..$ Petal.Width : num [1:50] 2.5 1.9 2.1 1.8 2.2 2.1 1.7 1.8 1.8 2.5 ...
..$ Species : Factor w/ 3 levels "setosa","versicolor",..: 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 ...
リスト成分名をファイル名にしてデータを保存する
やりたかったのは、このようなリストがあるときに、
- 個々のリスト成分下のデータフレームから
Sepal.Length
とPetal.Length
列を抜き出し、それをcsvファイルに出力する - そして出力先のファイル名を、
setosa_Length.csv
やversicolor_Length.csv
のように、リスト成分名から取ること でした。
最初は、
# NG例
df_list_iris %>%
map(
~write_csv(.x[c("Sepal.Length","Petal.Length")],
file = paste0(names(.x),"_Length.csv"))
)
のようにすればいけるのかと思ったのですが、map内ではリストの成分名をこの記述で取り出すことはできず、エラーが出ます。
思い通りの結果を得るには、map2を使い、リストとリストの成分名の2つを引数にする必要がありました。
# 成功例
map2(
df_list_iris, #引数x(リスト)
names(df_list_iris), #引数y(リストの成分名)
~write_csv(
.x[c("Sepal.Length","Petal.Length")], #任意の列を指定
file = paste0(.y, "_Length.csv") #ファイル名を指定
)
)
これで出来ました。
参考情報
上で書いたプログラムに関連する内容が含まれているwebページです。